在接種環(huán)節(jié)，污染食用菌菌種的雜菌很多，包括細(xì)菌、霉菌、酵母菌、放線菌等。如果在接種前及接種中，能夠有效滅殺環(huán)境的微生物，將有效的提高食用菌的接種成功率。專業(yè)從事食品消毒技術(shù)研發(fā)、制造的上海康久消毒技術(shù)有限公司董迎紅經(jīng)理告知：菌種遭受微生物污染的原因主要有以下幾方面：
　　一、菌種培養(yǎng)室陰暗潮濕、空氣污濁，空氣中含很多雜菌，污染了食用菌菌種。采用雙核技術(shù)的臭氧發(fā)生器或不衰減技術(shù)臭氧發(fā)生器（專業(yè)消毒設(shè)備，二選一）進(jìn)行消毒，臭氧的殺菌濃度≥10ppm，達(dá)到殺菌濃度后再持續(xù)開機(jī)30分鐘，可以有效的殺滅旮旮旯旯內(nèi)的各種霉菌、自然菌等。
　　二、接種室消毒不嚴(yán)。未采用合適的方法，對(duì)接種室進(jìn)行有效的殺菌消毒。采用“白+黑”殺菌工藝，所謂“動(dòng)態(tài)消毒”即需要?jiǎng)討B(tài)消毒和靜態(tài)消毒的配套進(jìn)行。
　　白天工人工作的時(shí)候采用動(dòng)態(tài)消毒設(shè)備：如食品動(dòng)態(tài)消毒機(jī)，近年來這一設(shè)備也廣泛用于一些大型食品企業(yè)的包裝、冷卻及灌裝環(huán)節(jié)，是真正意義上的食品企業(yè)專用的動(dòng)態(tài)消毒設(shè)備。在動(dòng)態(tài)有人情況下，采用Nicoler殺菌腔殺菌；其消毒過程為：開機(jī)時(shí)，將室內(nèi)的含菌空氣吸到機(jī)器內(nèi)，在等離子體靜電場(chǎng)內(nèi)施加0.5-1.2萬伏高壓，產(chǎn)生高濃度的離子體，使通過含菌空氣迅速被極化，高壓電荷瞬間釋放能量擊穿微生物細(xì)胞壁，從而導(dǎo)致細(xì)菌死亡。在對(duì)消毒滅菌時(shí)，人可同時(shí)在室內(nèi)生產(chǎn)生活，對(duì)人體無危害；主要用于在有人工作的情況下，同步動(dòng)態(tài)殺菌消毒，使受控環(huán)境保持在“無菌無塵”標(biāo)準(zhǔn)。由于在對(duì)車間消毒時(shí)，人可同時(shí)在車間內(nèi)工作，所以，該種殺菌機(jī)稱作食品動(dòng)態(tài)消毒。該機(jī)器是一種成熟的消毒技術(shù)，對(duì)人體沒有任何傷害，主要用于在有人工作的情況下同步動(dòng)態(tài)殺菌消毒。
　　晚上工人下班后采用靜態(tài)消毒設(shè)備，一個(gè)細(xì)菌在24小時(shí)內(nèi)會(huì)繁殖成百上千甚至上百萬細(xì)菌，利用臭氧消毒能夠有效地滅活各種細(xì)菌。專業(yè)從事臭氧殺菌技術(shù)研發(fā)、制造的上?？稻孟炯夹g(shù)有限公司董迎紅經(jīng)理告知：臭氧殺菌后，必須進(jìn)行嚴(yán)格的殺菌效果驗(yàn)證，才能保障食品安全，其驗(yàn)收標(biāo)準(zhǔn)如下：1、常規(guī)企業(yè)的臭氧殺菌默認(rèn)標(biāo)準(zhǔn)：聞到臭氧味道就具備殺菌效果：臭氧濃度≥0.5ppm即可去除異味；0.5～1.0ppm即可殺滅空氣中80%自然菌，濃度越高殺菌效果就越好；需要說明的是，相對(duì)濕度＜45%，臭氧對(duì)空氣環(huán)境中微生物幾乎沒有殺滅作用，在≥60%時(shí)逐漸增強(qiáng)，在95%時(shí)達(dá)到大值。2、對(duì)產(chǎn)品質(zhì)量要求較高企業(yè)的標(biāo)準(zhǔn)，10萬等級(jí)凈化車間驗(yàn)收濃度≥10ppm，達(dá)標(biāo)濃度≤60分鐘；達(dá)到規(guī)定各級(jí)別規(guī)定濃度后，再持續(xù)殺菌30分鐘即可完成完整的殺菌過程。
　　三、培養(yǎng)料滅菌不*，被雜菌污染。滅菌不*的原因主要有：1）滅菌操作不當(dāng)。采用常壓100℃、6-8小時(shí)或高壓121℃、0.5-2小時(shí)的滅菌方法，均能殺死一般雜菌的菌絲體與孢子。目前，食用菌培養(yǎng)料多采用常壓滅菌或高壓滅菌方法。常壓滅菌對(duì)谷粒、糞草等材料的滅菌難度較大，不容易達(dá)到*滅菌的效果；而高壓滅菌法的效果更好。2）培養(yǎng)料的不同。制作菌種所需材料的種類、培養(yǎng)料的含菌量、含水量以及酸堿度等因素都會(huì)影響滅菌效果。應(yīng)根據(jù)不同培養(yǎng)料的特性，選擇相應(yīng)的滅菌時(shí)間。3）菌種包裝容器的影響。制種時(shí)，一般用瓶或袋包裝菌種。塑料袋傳熱速度快，而玻璃瓶傳熱速度則慢些。在相同培養(yǎng)料、使用相同的滅菌方法時(shí)，瓶裝料要比袋裝料滅菌時(shí)間更長。
　　四、菌種中含有雜菌。用于擴(kuò)大培養(yǎng)的食用菌菌種的原種本身必須是純菌，這樣才能保證菌種的單一性。如果食用菌菌種中含有雜菌，則會(huì)導(dǎo)致接種率下降。
　　五、接種人員操作不當(dāng)。食用菌接種過程需要嚴(yán)格的無菌操作環(huán)境，如操作不規(guī)范，則易導(dǎo)致培養(yǎng)料被雜菌污染。污染培養(yǎng)料的雜菌一般是接種室空氣中的雜菌、菌袋表面的雜菌以及接種人員的體表雜菌等，采用“白＋黑”的殺菌組合工藝，可以有效控制雜菌污染問題，也可以有效的提高食用菌接種的成功率。